随后，枫丹军队通过建立多个隔离区和设计武装机器人、无人机智能巡逻的方式隔绝人类与崩坏兽。最后，在隔离了数月后，枫丹军队在大部分崩坏兽虚弱或死亡的时候同时发动反击，在几乎兵不血刃的情况下收复了所有的国土。

与此同时，在璃月、枫丹局势稳定的情况下，红钢军队组织了大规模行动，在璃月和枫丹的支持下，开展了代号为“沙漠风暴”的军事行动。

2245年11月5日

在红钢、枫丹、璃月以及提瓦特联盟的共同协作下，100个师，超过100万名的官兵发动“沙漠风暴”行动，利用水路、陆路、空路等方式先后在甘露花海、奥摩斯港、上风蚀地等190处地方发动大规模进攻。

这场大反攻的行动让律者措手不及，大量崩坏兽很快被潮水般的军队分割包围并消灭，此外，AH-3病毒也随着军队战线的深入开始在西部沙漠大面积感染崩坏兽。

2246年5月4日

在近半年的战斗中，红钢等国成功收复了西部沙漠地区并彻底消灭了盘踞在沙漠的崩坏兽，将律者及崩坏的领地压缩在了纳塔、稻妻西部一带，为开辟纳塔战场打下了重要基础。

与此同时，另外一边......

稻妻

荒坂公司虽然通过发动政变夺取了军队领导权，一定程度上扭转了稻妻的不利，但此时各国都忙于纳塔的封锁，实在是没有过多的精力去援助稻妻。

因此，荒坂公司这边成立的稻妻临时政府是一边抵抗着崩坏一边整顿内部。在对抗崩坏的战争中，下北泽也因为战争而毁灭，临时政府不得不搬迁至踏鞴砂一带。

而随着反攻的开始，稻妻终于获得了他国的援助。此时，如何将雷电将军从律者手上抢回摆在了众人面前。

在科学技术飞速发展的情况下，除了稻妻外，各国都对稻妻特有的“人偶”技术展开了一系列的研究并取得了相关进展。

当雷电将军被律者控制的时候，荒坂公司几乎是把自己的本钱全部投入，试图找到解除的方法，在经历了一次又一次的穷举法后，稻妻人根据人偶的特性，设计了一种“程序”。

这种“程序”被装入一支疑似手枪的注射器中，在注入人偶的时候就能彻底清除崩坏能的影响，让雷电将军再次被唤醒。

不过，这里有一个重要前提，那就是对方能配合自己的工作，在幕府军组织了几次“刺杀行动”且均失败的情况下，没人认为有人能近身雷电将军。

因此，计划陷入了停滞，人们的精力再次放在了对抗崩坏上。